El IEHMP cuenta con tres comisiones especializadas que desarrollan sus fines y atribuciones en el ámbito estratégico, científico y histórico del poder marítimo nacional.
Tiene como finalidad contribuir al diseño, desarrollo, consolidación y divulgación de una estrategia para el desarrollo nacional, comprendiendo actividades de análisis, investigación, estudios y creación a nivel nacional e internacional en las áreas de la geopolítica, geografía económica y la política social, entre otras relacionadas con el desarrollo nacional
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Está destinada a contribuir con las investigaciones y estudios científicos y tecnológicos relacionados con los intereses nacionales del país, con la finalidad de aportar en la formulación y fortalecimiento permanente de la Política Nacional para el Desarrollo Nacional.
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Tiene por finalidad asesorar y coordinar la preparación, investigación, desarrollo y divulgación de la historia nacional del país. Asimismo, promueve todas aquellas actividades vinculadas al quehacer histórico del país. Es responsable del cumplimiento de los fines de la institución, de acuerdo con el Estatuto.
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